PCR反應體系構建引物應遵循的原則
點擊次數:1697次 更新時間:2020-10-26
PCR(Polymerase Chain Reaction)反應體系是20世紀80年代中期發展起來的體外核酸擴增技術。具有易自動化\特異、敏感、產率高、簡便、快速、重復性好等突出優點;能在一個試管內將所要研究的目的基因或某一DNA的片段于在數小時內擴增至十萬乃至百萬倍,使肉眼能直接觀察和判斷;或者可從一根毛發、一滴血、甚至一個細胞中,擴增出足量的DNA供分析研究和檢測鑒定。過去需要幾天甚至幾星期才能做到的事情,用PCR技術只需在幾小時以內便可完成。PCR技術是生物醫學領域中的一項創舉和里程碑。
PCR反應體系構建中引物是特異性反應的關鍵,PCR產物的特異性取決于引物與模板DNA互補的程度。理論上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其設計互補的寡核昔酸鏈作引物,利用PCR就可將模板DNA在體外擴增。
PCR反應體系構建引物應遵循的原則:
1.引物長度:15-30bp,常用為20bp左右;
2.引物的特異性:引物應與核酸序列數據庫的其他序列無明顯同源性;
3.避免引物內部出現二級結構,避免兩條引物間互補,特別是3’端的互補,否則會形成引物二聚體,產生非特異的擴增條帶;
4.引物堿基:G+C含量以40%-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現非特異條帶。ATGC一般隨機分布,避免5個以上的嚎吟或e陡核昔酸的成串排列;
5.引物3’端的堿基,特別是末及倒數第二個堿基,應嚴格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗;
6.引物中有或能加上合適的酶切位點,被擴增的靶序列一般要有適宜的酶切位點,這對酶切分析或分子克隆很有好處;
7.引物擴增跨度:以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。
引物量:每條引物的濃度0.1-1μmol/L或10-l00pmol/L,以Z 低引物量產生所需要的結果為好,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴增,且可增加引物之間形成二聚體的機會。